PENENTUAN VARIASI GENETIK IKAN BATAK (Tor soro) DARI SUMATERA UTARA DAN JAWA BARAT DENGAN METODE ANALISIS RANDOM AMPLIFIED POLYMORPHISM DNA (RAPD)

Sidi Asih; Estu Nugroho; Anang Hari Kristanto; Mulyasari Mulyasari

doi:10.15578/jra.3.1.2008.91-97

PENENTUAN VARIASI GENETIK IKAN BATAK (Tor soro) DARI SUMATERA UTARA DAN JAWA BARAT DENGAN METODE ANALISIS RANDOM AMPLIFIED POLYMORPHISM DNA (RAPD)

Authors

Sidi Asih Balai Riset Perikanan Budidaya Air Tawar, Bogor
Estu Nugroho Balai Riset Perikanan Budidaya Air Tawar, Bogor
Anang Hari Kristanto Balai Riset Perikanan Budidaya Air Tawar, Bogor
Mulyasari Mulyasari Balai Riset Perikanan Budidaya Air Tawar, Bogor

DOI:

https://doi.org/10.15578/jra.3.1.2008.91-97

Keywords:

genetic variation, Tor soro, RAPD methods

Abstract

Variasi genetik ikan batak yang dikoleksi dari daerah Asahan, Aek Sarul (Tarutung), Aek Sirambe, Bahorok (Sumatera Utara), dan Sumedang (Jawa Barat) telah diteliti menggunakan metode Random Amplified Polymorphism DNA (RAPD). Primer yang digunakan untuk analisis adalah OPC-01 dan OPC-02. Dari 2 primer yang digunakan hanya OPC-01 yang menunjukkan hasil PCR yang memberikan Polimorfisme. Berdasarkan nilai rata-rata heterozigositas (0,08â€”0,1250) dan persentase lokus polimorfik (22%â€”33%) secara umum menunjukkan bahwa keragaman genetik ikan batak yang dianalisis tergolong rendah. Hasil analisis RAPD juga menunjukkan bahwa secara genetik tidak ada perbedaan yang nyata di antara kelima populasi ikan batak.

The genetic variabilities of Tor soro collected from Asahan, Aek Sarula (Tarutung), Aek Sirambe, Bahorok (North Sumatra), and Sumedang (West Java) were examined by RAPD. Primers used for analysis were OPC-01 and OPC-02. From both of the primers, only OPC-01 showed polymorphism. Based on the heterozigosity (0.08â€”0.1250) and percentage of polimorphyc locus value (22%â€”33%), indicated that genetic variation of Tor soro of North Sumatra was low. The RAPD analisis showed that no significantly difference among five population.

Downloads

Published

2016-12-01

How to Cite

Asih, S., Nugroho, E., Kristanto, A. H., & Mulyasari, M. (2016). PENENTUAN VARIASI GENETIK IKAN BATAK (Tor soro) DARI SUMATERA UTARA DAN JAWA BARAT DENGAN METODE ANALISIS RANDOM AMPLIFIED POLYMORPHISM DNA (RAPD). Jurnal Riset Akuakultur, 3(1), 91–97. https://doi.org/10.15578/jra.3.1.2008.91-97

Download Citation

Issue

Vol. 3 No. 1 (2008): (April 2008)

Section

Articles

License

Jurnal Riset Akuakultur is licensed under a Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License.Â

Most read articles by the same author(s)

Estu Nugroho, Alimuddin Alimuddin, Anang Hari Kristanto, Odang Carman, Novi Megawati, Komar Sumantadinata, KLONING cDNA HORMON PERTUMBUHAN DARI IKAN GURAME (Osphronemus gouramy) , Jurnal Riset Akuakultur: Vol. 3 No. 2 (2008): (Agustus 2008)
Titin Kurniasih, Widanarni Widanarni, Mulyasari Mulyasari, Irma Melati, Zafril Imran Azwar, Angela Mariana Lusiastuti, ISOLASI, SELEKSI, DAN IDENTIFIKASI BAKTERI DARI SALURAN PENCERNAAN IKAN LELE SEBAGAI KANDIDAT PROBIOTIK , Jurnal Riset Akuakultur: Vol. 8 No. 2 (2013): (Agustus 2013)
Mulyasari Mulyasari, Dinar Tri Soelistyowati, Anang Hari Kristanto, Irin Iriana Kusmini, KARAKTERISTIK GENETIK ENAM POPULASI IKAN NILEM (Osteochilus hasselti) DI JAWA BARAT , Jurnal Riset Akuakultur: Vol. 5 No. 2 (2010): (Agustus 2010)
Idil Ardi, Eri Setiadi, Anang Hari Kristanto, Ani Widiyati, SALINITAS OPTIMAL UNTUK PENDEDERAN BENIH IKAN BETUTU (Oxyeleotris marmorata) , Jurnal Riset Akuakultur: Vol. 11 No. 4 (2016): (Desember 2016)
Mulyasari Mulyasari, Irma Melati, Mas Tri Djoko Sunarno, ISOLASI, SELEKSI, DAN IDENTIFIKASI BAKTERI SELULOLITIK DARI RUMPUT LAUT Turbinaria sp. DAN Sargassum sp. SEBAGAI KANDIDAT PENDEGRADASI SERAT KASAR PAKAN IKAN , Jurnal Riset Akuakultur: Vol. 10 No. 1 (2015): (Maret 2015)
Jojo Subagja, Deni Radona, Anang Hari Kristanto, PERKEMBANGAN GONAD DAN PERTUMBUHAN IKAN NILEM BETINA ALL FEMALE HASIL FERTILISASI JANTAN NEOMALE , Jurnal Riset Akuakultur: Vol. 12 No. 2 (2017): (Juni 2017)
Vitas Atmadi Prakoso, Muhamad Hunaina Fariduddin Ath-thar, Jojo Subagja, Anang Hari Kristanto, PERTUMBUHAN IKAN UCENG (Nemacheilus fasciatus) DENGAN PADAT TEBAR BERBEDA DALAM LINGKUNGAN EX SITU , Jurnal Riset Akuakultur: Vol. 11 No. 4 (2016): (Desember 2016)
Irin Iriana Kusmini, Anang Hari Kristanto, Jojo Subagja, Vitas Atmadi Prakoso, Fera Permata Putri, RESPONS DAN POLA PERTUMBUHAN BENIH ikan baung (Hemibagrus nemurus) DARI TIGA GENERASI DIPELIHARA PADA WADAH BUDIDAYA YANG BERBEDA , Jurnal Riset Akuakultur: Vol. 13 No. 3 (2018): (September 2018)
Iswari Ratna Astuti, Tri Heru Prihadi, Hambali Supriyadi, Anang Hari Kristanto, TEKNIK PENGENDALIAN PENYAKIT KHV PADA IKAN MAS (Cyprinus carpio) MELALUI MANIPULASI LINGKUNGAN DALAM SKALA LABORATORIUM , Jurnal Riset Akuakultur: Vol. 7 No. 3 (2012): (Desember 2012)
Anang Hari Kristanto, Jojo Subagja, Wahyulia Cahyanti, Otong Zenal Arifin, EVALUASI VARIASI FENOTIPE DAN GENOTIPE POPULASI IKAN TAMBAKAN DARI JAWA BARAT, KALIMANTAN TENGAH, DAN JAMBI DENGAN TRUSS MORFOMETRIK DAN RANDOM AMPLIFIED POLYMORPHIC DNA (RAPD) , Jurnal Riset Akuakultur: Vol. 12 No. 3 (2017): (September 2017)

1 2 3 4 5 > >>

PENENTUAN VARIASI GENETIK IKAN BATAK (Tor soro) DARI SUMATERA UTARA DAN JAWA BARAT DENGAN METODE ANALISIS RANDOM AMPLIFIED POLYMORPHISM DNA (RAPD)