DESAIN PRIMER SPESIFIK UNTUK DETEKSI DINI PENYAKIT VIBRIOSIS PADA UDANG PENAEID

Ince Ayu Khairana Kadriah; Endang Susianingsih; Sukenda Sukenda; Munti Yuhana; Enang Harris

doi:10.15578/jra.8.1.2013.131-143

DESAIN PRIMER SPESIFIK UNTUK DETEKSI DINI PENYAKIT VIBRIOSIS PADA UDANG PENAEID

Authors

Ince Ayu Khairana Kadriah Balai Penelitian dan Pengembangan Budidaya Air Payau, Maros
Endang Susianingsih Balai Penelitian dan Pengembangan Budidaya Air Payau, Maros
Sukenda Sukenda Departemen Budidaya Perairan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Institut Pertanian Bogor, Bogor
Munti Yuhana Departemen Budidaya Perairan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Institut Pertanian Bogor, Bogor
Enang Harris Departemen Budidaya Perairan, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan, Institut Pertanian Bogor, Bogor

DOI:

https://doi.org/10.15578/jra.8.1.2013.131-143

Keywords:

vibriosis, udang penaeid, PCR, deteksi cepat, penanda molekuler spesifik

Abstract

Serangan Vibriosis, yang disebabkan oleh Vibrio harveyi berpendar pada budidayaÂ udang telah menyebabkan penurunan yang signifikan dalam produksi, baik padaÂ pembenihan maupun di tambak pembesaran. Pengembangan metode deteksi cepatÂ berbasis PCR (Polymerase Chain Reaction) sangat penting untuk mencegah penularanÂ vibriosis. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengembangkan metode cepat deteksiÂ vibriosis pada udang penaeid dengan menggunakan penanda molekuler yang spesifik.Â PCR berbasis deteksi gen spesifik dilakukan menggunakan primer spesifik toxR,Â haemolysin (vvh), dan gyrB. Dari 35 isolat, 22 isolat yang terdeteksi memiliki genÂ spesifik toxR, haemolysin (vvh) dan gen gyrB dan 9 isolat terdeteksi memiliki dua genÂ tertentu. Penanda molekuler spesifik telah dirancang menggunakan data urutan genÂ penyandi protein haemolysin dan gyrase. Desain pasangan primer yang didasarkanÂ pada program perangkat lunak dari Primer3 dan secara manual menggunakan programÂ perangkat lunak Bioedit. Tiga pasangan primer untuk gen haemolysin dan dua primerÂ gyrase telah diperoleh dan dipilih sebagai primer.

Downloads

Published

2014-04-30

How to Cite

Kadriah, I. A. K., Susianingsih, E., Sukenda, S., Yuhana, M., & Harris, E. (2014). DESAIN PRIMER SPESIFIK UNTUK DETEKSI DINI PENYAKIT VIBRIOSIS PADA UDANG PENAEID. Jurnal Riset Akuakultur, 8(1), 131–143. https://doi.org/10.15578/jra.8.1.2013.131-143

Download Citation

Issue

Vol. 8 No. 1 (2013): (April 2013)

Section

Articles

License

Jurnal Riset Akuakultur is licensed under a Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License.Â

Most read articles by the same author(s)

Tatik Mufidah, Sukenda Sukenda, Widanarni Widanarni, Huda Shalahudin Darusman, Angela Mariana Lusiastuti, PROFIL FARMAKOKINETIK OKSITETRASIKLIN PADA IKAN LELE, Clarias gariepinus DENGAN INFEKSI ARTIFISIAL Aeromonas hydrophila , Jurnal Riset Akuakultur: Vol. 17 No. 1 (2022): (Maret, 2022)
Tuti Sumiati, Sukenda Sukenda, Sri Nuryati, Angela Mariana Lusiastuti, PENGEMBANGAN METODE ELISA UNTUK MENDETEKSI RESPON IMUN SPESIFIK PADA IKAN NILA (Oreochromis niloticus) YANG DIVAKSINASI TERHADAP Aeromonas hydrophila DAN Streptococcus agalactiae , Jurnal Riset Akuakultur: Vol. 10 No. 2 (2015): (Juni 2015)
Siti Subaidah, Odang Carman, Komar Sumantadinata, Sukenda Sukenda, Alimuddin Alimuddin, RESPONS PERTUMBUHAN DAN EKSPRESI GEN UDANG VANAME, Litopenaeus vannamei SETELAH DIRENDAM DALAM LARUTAN HORMON PERTUMBUHAN REKOMBINAN IKAN KERAPU KERTANG , Jurnal Riset Akuakultur: Vol. 7 No. 3 (2012): (Desember 2012)
Desy Sugiani, Sukenda Sukenda, Enang Harris, Angela Mariana Lusiastuti, VAKSINASI IKAN TILAPIA (Oreochromis niloticus) MENGGUNAKAN VAKSIN MONOVALEN DAN BIVALEN UNTUK PENCEGAHAN PENYAKIT MOTILE AEROMONAS SEPTICEMIA DAN STREPTOCOCCOSIS , Jurnal Riset Akuakultur: Vol. 8 No. 2 (2013): (Agustus 2013)
Armen Nainggolan, Agus Oman Sudrajat, Nur Bambang Priyo Utomo, Enang Harris, PENINGKATAN KINERJA REPRODUKSI, KUALITAS TELUR, DAN LARVA MELALUI SUPLEMENTASI Spirulina DIKOMBINASI DENGAN INJEKSI OOCYTE DEVELOPER PADA INDUK IKAN LELE (Clarias sp.) BETINA , Jurnal Riset Akuakultur: Vol. 10 No. 2 (2015): (Juni 2015)
Ronald Kriston Sauttua Nainggolan, Munti Yuhana, Sukenda Sukenda, Woro Nur Endang Sariati, DETEKSI Vibrio parahaemolyticus MENGGUNAKAN MARKA GEN PirA PADA UDANG VANAME (Litopenaeus vannamei) DENGAN REAL TIME PCR , Jurnal Riset Akuakultur: Vol. 15 No. 2 (2020): (Juni, 2020)
Widanarni Widanarni, Muhamad Gustilatov, Sukenda Sukenda, Diah Ayu Satyari Utami, PEMANFAATAN MADU UNTUK MENINGKATKAN RESPONS IMUN DAN RESISTANSI UDANG VANAME (Litopenaeus vannamei) TERHADAP INFEKSI White Spot Syndrome Virus , Jurnal Riset Akuakultur: Vol. 14 No. 1 (2019): (Maret, 2019)
Iis Sumartini, Widanarni Widanarni, Munti Yuhana, Ayi Santika, PERFORMA PERTUMBUHAN DAN RESPONS IMUN IKAN LELE (Clarias sp.) DENGAN PEMBERIAN PROBIOTIK, PREBIOTIK, DAN SINBIOTIK , Jurnal Riset Akuakultur: Vol. 13 No. 4 (2018): (Desember 2018)
Rasidi Rasidi, Dedi Jusadi, Mia Setiawati, Munti Yuhana, Muhammad Zairin Jr., Ketut Sugama, PENGARUH PENAMBAHAN ASAM HUMAT PADA PAKAN MENGANDUNG KADMIUM (Cd) DARI KERANG HIJAU TERHADAP BIOELIMINASI Cd, STATUS KESEHATAN, DAN PERTUMBUHAN IKAN KAKAP PUTIH Lates calcarifer , Jurnal Riset Akuakultur: Vol. 15 No. 1 (2020): (Maret, 2020)
Usman Usman, Neltje Nobertine Palinggi, Enang Harris, Dedi Jusadi, Eddy Supriyono, PENGARUH MANAJEMEN PEMBERIAN PAKAN TERHADAP PEMANFAATAN BIOFLOK UNTUK PERTUMBUHAN IKAN BANDENG , Jurnal Riset Akuakultur: Vol. 6 No. 3 (2011): (Desember 2011)

1 2 3 4 > >>

DESAIN PRIMER SPESIFIK UNTUK DETEKSI DINI PENYAKIT VIBRIOSIS PADA UDANG PENAEID